Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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