Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MRTO4Q9UKD2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms