Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED13Q9UHV7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms