Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NPC1L1Q9UHC9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms