Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18L2Q9UHA2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms