Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms