Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms