Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DKK3Q9UBP4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms