Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms