Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CCDC180Q9P1Z9 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms