Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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SH3BP4Q9P0V3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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SH3BP4Q9P0V3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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SH3BP4Q9P0V3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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SH3BP4Q9P0V3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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SH3BP4Q9P0V3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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SH3BP4Q9P0V3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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SH3BP4Q9P0V3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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SH3BP4Q9P0V3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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