Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VNN3Q9NY84 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VNN3Q9NY84 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms