Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THUMPD1Q9NXG2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THUMPD1Q9NXG2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms