Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms