Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SERINC1Q9NRX5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms