Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHST12Q9NRB3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms