Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms