Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZYG11BQ9C0D3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms