Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4CQ9C0C4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms