Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM4Q9C037 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms