Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRP1Q9C000 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms