Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSDMCQ9BYG8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms