Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSPO3Q9BXY4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms