Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SNHG12Q9BXW3 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SNHG12Q9BXW3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms