Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TDRD1Q9BXT4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TDRD1Q9BXT4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms