Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRRTQ9BXP5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SRRTQ9BXP5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SRRTQ9BXP5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SRRTQ9BXP5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SRRTQ9BXP5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SRRTQ9BXP5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SRRTQ9BXP5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SRRTQ9BXP5 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRRTQ9BXP5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRRTQ9BXP5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRRTQ9BXP5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRRTQ9BXP5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRRTQ9BXP5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRRTQ9BXP5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRRTQ9BXP5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRRTQ9BXP5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRRTQ9BXP5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRRTQ9BXP5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRRTQ9BXP5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SRRTQ9BXP5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SRRTQ9BXP5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRRTQ9BXP5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRRTQ9BXP5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRRTQ9BXP5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRRTQ9BXP5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRRTQ9BXP5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRRTQ9BXP5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SRRTQ9BXP5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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