Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM0

PRX, Periaxin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRXQ9BXM0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRXQ9BXM0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms