Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R3Q9BXE9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms