Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBA1CQ9BQE3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms