Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRG3Q99928 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRG3Q99928 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRG3Q99928 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRG3Q99928 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRG3Q99928 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRG3Q99928 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRG3Q99928 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRG3Q99928 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRG3Q99928 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRG3Q99928 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRG3Q99928 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRG3Q99928 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRG3Q99928 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRG3Q99928 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRG3Q99928 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRG3Q99928 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRG3Q99928 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRG3Q99928 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRG3Q99928 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRG3Q99928 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRG3Q99928 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRG3Q99928 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRG3Q99928 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRG3Q99928 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRG3Q99928 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRG3Q99928 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRG3Q99928 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms