Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q80

DERL3, Derlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DERL3Q96Q80 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DERL3Q96Q80 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms