Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EP400Q96L91 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms