Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPNS2Q96L46 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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