Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRIQ1Q96JM4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
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