Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCC12Q96J65 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms