Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms