Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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RNF185Q96GF1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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RNF185Q96GF1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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RNF185Q96GF1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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RNF185Q96GF1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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RNF185Q96GF1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
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