Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3C6Q969F1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms