Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD50Q92878 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD50Q92878 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD50Q92878 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD50Q92878 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD50Q92878 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD50Q92878 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD50Q92878 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD50Q92878 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD50Q92878 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD50Q92878 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD50Q92878 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD50Q92878 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD50Q92878 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD50Q92878 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD50Q92878 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD50Q92878 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD50Q92878 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD50Q92878 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD50Q92878 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD50Q92878 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD50Q92878 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD50Q92878 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD50Q92878 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD50Q92878 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD50Q92878 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD50Q92878 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD50Q92878 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD50Q92878 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD50Q92878 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD50Q92878 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD50Q92878 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD50Q92878 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD50Q92878 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAD50Q92878 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms