Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms