Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TOPBP1Q92547 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms