Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NCSTNQ92542 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NCSTNQ92542 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCSTNQ92542 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCSTNQ92542 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCSTNQ92542 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCSTNQ92542 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCSTNQ92542 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NCSTNQ92542 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCSTNQ92542 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCSTNQ92542 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCSTNQ92542 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCSTNQ92542 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCSTNQ92542 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCSTNQ92542 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCSTNQ92542 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms