Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVB3

HEXDC, Hexosaminidase D, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HEXDCQ8WVB3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HEXDCQ8WVB3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HEXDCQ8WVB3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms