Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEDD1Q8NHV4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms