Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA6DQ8NFY4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms