Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms