Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DTX3Q8N9I9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DTX3Q8N9I9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms