Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RTL3Q8N8U3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms