Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ96

CMTM1, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1Q8IZ96 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CMTM1Q8IZ96 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms