Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SKAP1Q86WV1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms